中科院分子细胞科学卓越创新中心陈玲玲研究组开发出名为 abcFISH 的环形 RNA 单分子原位成像新技术，成果发表在 Nature Methods 期刊上，这项技术专门瞄准环形 RNA 和同源线性 RNA 序列高度相似、很难区分的痛点，依靠滚环扩增精准识别环形 RNA 独有的反向剪接位点，实现高特异、高信噪比的单分子成像，支持多色多重检测，细胞、动物组织、存档病理石蜡切片都能使用，给环形 RNA 空间分布、功能研究和疾病病理检测提供了全新工具。环形 RNA 除了反向剪接位点之外，其余序列和同源线性 RNA 几乎一样，传统成像手段很容易交叉误识别，而且老方法要么对环形 RNA 长度要求高、短环形 RNA 测不了，要么商用试剂成本高、不支持多色成像，很难同时观察多种环形 RNA 在细胞里的位置，这些短板长期限制环形 RNA 空间异质性研究。这套 abcFISH 技术的实验操作流程清晰，第一步根据目标环形 RNA 反向剪接位点设计 padlock 探针与 primer 探针；第二步将探针和样本孵育，只有两条探针同时贴合在反向剪接位点才会触发连接；第三步启动滚环扩增放大荧光信号；第四步荧光显微镜成像采集信号；最后通过图像分析完成定量统计，区分不同环形 RNA 异构体。整体来看，abcFISH 突破了传统成像对环形 RNA 长度、丰度的限制，能分辨同一个基因产生的多种环形 RNA 异构体，还可以利用医院存档的 FFPE 病理样本开展回顾性研究，在肿瘤、神经相关疾病的环形 RNA 标志物挖掘上有很大潜力。
abcFISH 技术基础信息
- 技术名称：abcFISH
- 研发团队：中科院分子细胞科学卓越创新中心陈玲玲组
- 发表期刊：Nature Methods
- 核心原理：靶向反向剪接位点，结合滚环扩增 RCA
- 核心特点：单分子、原位、多重多色成像
- 适配样本：培养细胞、小鼠组织、福尔马林固定石蜡包埋 FFPE 切片
abcFISH 对比传统环形 RNA 成像方案
| 项目 | abcFISH 新技术 | 传统 smFISH | 商用 BaseScope |
|---|---|---|---|
| 识别靶点 | 反向剪接位点，特异性强 | 全长序列，容易和线性 RNA 混淆 | 反向剪接位点 |
| 长度限制 | 无强制长序列要求 | 需要足够长 RNA 容纳探针 | 有一定长度门槛 |
| 多重检测 | 支持多色、多种 circRNA 同时检测 | 多色能力弱 | 很难做多色成像 |
| 使用成本 | 成本可控，便于推广 | 中等 | 价格高昂 |
| 适配存档病理切片 | 支持 | 部分受限 | 支持但成本高 |
技术应用清单
- 观察环形 RNA 在细胞、组织里的原位分布、亚细胞定位
- 区分同一基因来源的多种环形 RNA 异构体
- 定量检测不同细胞、组织里环形 RNA 表达差异
- 利用存档病理切片开展疾病相关环形 RNA 标志物研究
- 解析环形 RNA 空间异质性，辅助肿瘤、神经疾病机制研究
【相关 FAQ】
问题 1：中科院团队开发 abcFISH 环形 RNA 单分子成像新技术，abcFISH 技术依靠什么原理识别环形 RNA？
回答 1：中科院团队开发 abcFISH 环形 RNA 单分子成像新技术，abcFISH 专门靶向环形 RNA 独有的反向剪接位点，搭配 padlock 探针、primer 探针和滚环扩增技术，只有探针同时结合到该位点才会产生荧光信号，避开线性 RNA 干扰。
问题 2：中科院团队开发 abcFISH 环形 RNA 单分子成像新技术，abcFISH 可以用哪些类型生物样本？
回答 2：中科院团队开发 abcFISH 环形 RNA 单分子成像新技术，abcFISH 适配培养细胞、小鼠新鲜组织，还有医院常见的福尔马林固定石蜡包埋 FFPE 病理存档切片。
问题 3：中科院团队开发 abcFISH 环形 RNA 单分子成像新技术，abcFISH 相比老方法最大优势是什么？
回答 3：中科院团队开发 abcFISH 环形 RNA 单分子成像新技术，它不容易和同源线性 RNA 交叉杂交，不受环形 RNA 长度、丰度限制，支持多色多重成像，成本更低，方便同时观察多种环形 RNA。
问题 4：中科院团队开发 abcFISH 环形 RNA 单分子成像新技术，这项新技术主要用来做什么研究？
回答 4：中科院团队开发 abcFISH 环形 RNA 单分子成像新技术，主要用来原位观察、定量环形 RNA，区分不同环形 RNA 异构体，研究环形 RNA 空间分布异质性，也为挖掘疾病环形 RNA 标志物提供工具。
【参考资料】
[2026-11-09]（研究人员开发环形 RNA 单分子成像新技术）学术桥
[2026-11-07]（陈玲玲组开发环形 RNA 单分子成像新技术 abcFISH）生物通
[2026-11-05]（abcFISH enables multiplexed, single-molecule visualization of circular RNA spatial heterogeneity）Nature Methods
[2026-11-05]（环形 RNA 成像新突破，陈玲玲团队 abcFISH 登上 Nature Methods）中国科学院分子细胞科学卓越创新中心官网
【免责声明】
本内容仅为 abcFISH 环形 RNA 成像新技术科研成果科普整理，不构成实验方案、临床检测指导；该技术仍属于实验室研究工具，尚未进入临床诊断应用，具体实验参数、操作细节请以论文原文、研发团队公开实验方案为准。
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希望本篇文章《中科院团队开发 abcFISH 环形 RNA 单分子成像新技术》能对你有所帮助！
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本文概览：中科院分子细胞科学卓越创新中心陈玲玲研究组开发出名为 abcFISH 的环形 RNA 单分子原位成像新技术，成果发表在 Nature Methods 期刊上，这项技术专门瞄准环形 RNA 和同源线性 RNA 序列高度相似、很难区分的痛点，依靠滚环扩增精准识别环形 RNA 独有的反向剪接位点，实现高特异、高信噪比的单分子成像，支持多色多重检测，细胞、动物组织、存档病理石蜡切片都能使用，给环形 RNA 空间分布、功能研究和疾病病理检测提供了全新工具。环形 RNA 除了反向剪接位点之外，其余序列和同源线性 RNA 几乎一样，传统成像手段很容易交叉误识别，而且老方法要么对环形 RNA 长度要求高、短环形 RNA 测不了，要么商用试剂成本高、不支持多色成像，很难同时观察多种环形 RNA 在细胞里的位置，这些短板长期限制环形 RNA 空间异质性研究。这套 abcFISH 技术的实验操作流程清晰，第一步根据目标环形 RNA 反向剪接位点设计 padlock 探针与 primer 探针；第二步将探针和样本孵育，只有两条探针同时贴合在反向剪接位点才会触发连接；第三步启动滚环扩增放大荧光信号；第四步荧光显微镜成像采集信号；最后通过图像分析完成定量统计，区分不同环形 RNA 异构体。整体来看，abcFISH 突破了传统成像对环形 RNA 长度、丰度的限制，能分辨同一个基因产生的多种环形 RNA 异构体，还可以利用医院存档的 FFPE 病理样本开展回顾性研究，在肿瘤、神经相关疾病的环形 RNA 标志物挖掘上有很大潜力。